Користувальницькькі налаштування

Налаштування сайту


hpc

Розбіжності

Тут показані розбіжності між вибраною ревізією та поточною версією сторінки.

Посилання на цей список змін

Both sides previous revision Попередня ревізія
hpc [2015/06/14 17:59]
wombat [Ссылки] LLNL tutorials
hpc [2016/09/15 08:58] (поточний)
wombat [OpenMP] ссылка на страницу OpenMP
Рядок 1: Рядок 1:
 +====== Параллельные вычисления ======
 +
 +===== OpenMP =====
 +
 +[[openmp|OpenMP]] -- очень удобный и простой способ распараллелить вычисления,​ проводимые в рамках одного компьютера (несколько ядер или процессоров,​ но общая оперативная память).
 +
 +https://​computing.llnl.gov/​tutorials/​openMP/​
 +
 +
 +
 +===== MPI =====
 +
 +
 +http://​www.mpi-forum.org/​docs/​docs.html
 +
 +https://​computing.llnl.gov/​tutorials/​mpi/​
 +
 +http://​mpitutorial.com/​beginner-mpi-tutorial/​
 +
 +
 +==== OpenMPI ====
 +
 +https://​www.open-mpi.org/​
 +
 +Сначала нужно настроить [[ssh#​подключение_по_ключу|доступ через SSH по ключу]].
 +
 +Для проверки работоспособности системы запустим программу ''​hostname''​ на нескольких компьютерах из локальной сети:
 +
 +  mpirun -np 2 --host 192.168.1.2,​192.168.1.3 hostname
 +
 +После написания [[mpi|программы]] с использованием технологии MPI, запустить её можно так:
 +
 +Компиляция:​
 +  mpicc -o mpi-test.bin mpi-test.c
 +
 +Копирование на другие компьютеры:​
 +  scp -P22 mpi-test.bin Calculator1:​~/​
 +
 +Выделение ресурсов [[slurm|SLURM]]:​
 +  salloc -n8 /bin/bash
 +
 +Запуск:​
 +  mpirun ./​mpi-test.bin
 +
 +Опыт показал,​ что вместо последних двух команд лучше задавать одну такую:
 +  salloc -n8 mpirun ./​mpi-test.bin
 +Тогда после завершения работы программы,​ соответствующее задание удаляется из очереди SLURM, и ресурсы освобождаются для следующих задач.
 +==== MPICH ====
 +
 +http://​www.mpich.org/​documentation/​guides/​
 +
 +
 +===== Планировщики задач =====
 +
 +https://​research.cs.wisc.edu/​htcondor/​manual/​v8.3/​2_9Parallel_Applications.html
 +
 +https://​computing.llnl.gov/​linux/​slurm/​
 +
 +http://​www.adaptivecomputing.com/​products/​open-source/​torque/​
 +
 +== Grun ==
 +
 +> A lightweight replacement for job queueing systems like LSF, Torque, condor, SGE, for private clusters.
 +> ...
 +> Grun doesn'​t support MPI and other fancy grid things (although you can layer map-reduce on it)
 +
 +https://​github.com/​earonesty/​grun
 +
 +
 +===== Ссылки =====
 +
 +https://​wiki.debian.org/​DebianBeowulf
 +
 +https://​wiki.debian.org/​DebianScience/​Grid
 +
 +https://​wiki.debian.org/​DebianScience
 +
 +https://​wiki.debian.org/​HighPerformanceComputing
 +
 +http://​www.debianclusters.net/​index.php/​Main_Page
 +
 +https://​research.cs.wisc.edu/​htcondor/​manual/​v8.3/​1_1High_Throughput_Computin.html
 +
 +http://​toolkit.globus.org/​toolkit/​
 +
 +http://​www.openlava.org/​
 +
 +http://​graal.ens-lyon.fr/​diet/​
 +
 +[[https://​computing.llnl.gov/​tutorials/​linux_clusters/​ | LLNL Linux Clusters Overview]]
 +
 +[[https://​computing.llnl.gov/​tutorials/​parallel_comp/​ | LLNL Introduction to Parallel Computing]]
 +
 +
 +
 +===== Видеокурсы =====
 +
 +https://​class.coursera.org/​scicomp-003
 +
 +====== Наблюдение/​Управление ======
 +
 +http://​ganglia.info
 +
 +
 +
  
hpc.txt · В останнє змінено: 2016/09/15 08:58 by wombat