Розбіжності

Тут показані розбіжності між вибраною ревізією та поточною версією сторінки.

--- geant4 [2014/07/31 06:24] – [Ссылки] GEANT4 Training Courses wombat
+++ geant4 [2021/11/10 08:47] (поточний) – [Файлы данных] Обновление до версии 10.7 wombat
@@ Рядок 6: / Рядок 6: @@
 ===== Из исходников =====
-Будем следовать рецепту((http://geant4.cern.ch/UserDocumentation/UsersGuides/InstallationGuide/html/ch02.html)) с официального сайта GEANT4. Установим пакеты, которые потребуются для сборки GEANT4:
+Будем следовать рецепту((https://geant4-userdoc.web.cern.ch/UsersGuides/InstallationGuide/html/installguide.html)) с официального сайта GEANT4. Установим пакеты, которые потребуются для сборки GEANT4:
-  apt-get install cmake libexpat1-dev
+  apt-get install build-essential cmake libexpat1-dev
 Если планируется использовать поддержку OpenGL, то:
-  apt-get install libglu1-mesa-dev
+  apt-get install libglu1-mesa-dev libxmu-dev
-  mkdir geant
+Если планируется использовать интерфейс Qt5, то:
-  cd geant
-  wget -cS 'http://geant4.cern.ch/support/source/geant4.10.00.p02.tar.gz'
+  apt-get install qtbase5-dev libqt5opengl5-dev
-  tar xvf geant4.10.00.p02.tar.gz
-  mkdir geant4.10.00.p02-build
+Если планируется использовать описание геометрии в формате [[https://gdml.web.cern.ch/GDML/|GDML]], то:
-  cd geant4.10.00.p02-build/
+  apt-get install libxerces-c-dev
+  mkdir /home/user/GEANT4-download
+  cd /home/user/GEANT4-download
+  wget -cS 'https://geant4-data.web.cern.ch/releases/geant4.10.07.p02.tar.gz'
+  tar -xvf geant4.10.07.p02.tar.gz
+  mkdir geant4.10.07.p02-build
+  cd geant4.10.07.p02-build/
 Без поддержки OpenGL (или интерактивного графического интерфейса вообще? FIXME ) :
-  cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install -DGEANT4_INSTALL_DATA=ON -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/geant/geant4.10.00.p02
+  cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4 -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/GEANT4-download/geant4.10.07.p02
-С поддержкой OpenGL для X11:
+Для поддержки OpenGL для X11: ''-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON''
-  cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install -DGEANT4_INSTALL_DATA=ON -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON -DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON /home/user/geant/geant4.10.00.p02
+Для поддержки интерфейса Qt: ''-DGEANT4_USE_QT=ON''
+Для поддержки файлов GDML: ''-DGEANT4_USE_GDML=ON''
+==== Файлы данных ====
+Если при конфигурировании отображается следующее предупреждение:
+<code>
+ *WARNING*
+    Geant4 has been pre-configured to look for datasets
+    in the directory:
+    /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data
+    but the following datasets are NOT present on disk at
+    that location:
+    G4NDL (4.6)
+    G4EMLOW (7.13)
+    PhotonEvaporation (5.7)
+    RadioactiveDecay (5.6)
+    G4PARTICLEXS (3.1.1)
+    G4PII (1.3)
+    RealSurface (2.2)
+    G4SAIDDATA (2.0)
+    G4ABLA (3.1)
+    G4INCL (1.0)
+    G4ENSDFSTATE (2.3)
+    If you want to have these datasets installed automatically
+    simply re-run cmake and set the GEANT4_INSTALL_DATA
+    variable to ON. This will configure the build to download
+    and install these datasets for you. For example, on the
+    command line, do:
+    cmake -DGEANT4_INSTALL_DATA=ON <otherargs>
+    The variable can also be toggled in ccmake or cmake-gui.
+    If you're running on a Windows system, this is the best
+    solution as CMake will unpack the datasets for you
+    without any further software being required
+    Alternatively, you can install these datasets manually
+    now or after you have installed Geant4. To do this,
+    download the following files:
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4NDL.4.6.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4EMLOW.7.13.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PhotonEvaporation.5.7.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4RadioactiveDecay.5.6.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PARTICLEXS.3.1.1.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PII.1.3.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4RealSurface.2.2.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4SAIDDATA.2.0.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4ABLA.3.1.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4INCL.1.0.tar.gz
+    https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4ENSDFSTATE.2.3.tar.gz
+    and unpack them under the directory:
+    /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data
+    As we supply the datasets packed in gzipped tar files,
+    you will need the 'tar' utility to unpack them.
+    Nota bene: Missing datasets will not affect or break
+               compilation and installation of the Geant4
+               libraries.
+</code>
+это означает, что файлы данных ещё не установлены. Их можно установить прямо во время сборки, передав cmake параметр ''-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON''. Но это потребует скачивания из интернета (несколькосот МБ). Если эти файлы уже скачаны, их можно вручную распаковать в нужную папку, как и подсказывает нам текст предупреждения. Для этого:
+  mkdir -p /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data
+  cd /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ABLA.3.1.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4EMLOW.7.13.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ENSDFSTATE.2.3.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4INCL.1.0.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4NDL.4.6.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PARTICLEXS.3.1.1.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PhotonEvaporation.5.7.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PII.1.3.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4RadioactiveDecay.5.6.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4SAIDDATA.2.0.tar.gz
+  tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4RealSurface.2.2.tar.gz
+После чего можно заново запустить cmake, как это делалось ранее, чтобы убедиться, что он находит все установленные файлы данных. Если это так, можно переходить к компиляции и установке:
   time make -j4
@@ Рядок 33: / Рядок 128: @@
+===== G4MPI =====
+Для использования технологий MPI в GEANT4, нужно скомпилировать и установить библиотеку G4MPI. Она поставляется в архиве последних версий GEANT4 в разделе примеров((http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html)).
+  mkdir G4MPI.build && cd G4MPI.build
+  cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4/G4MPI /home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source
+  make
+Если компилятор выдаёт ошибку, приведённую ниже, это означает, что в системе установлена старая версия MPI.
+<code>
+/home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc: In member function ‘void G4MPIscorerMerger::Pack(const G4VScoringMesh*)’:
+/home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc:309:37: error: invalid conversion from ‘const void*’ to ‘void*’ [-fpermissive]
+           &outputBufferPosition,comm);
+                                     ^
+</code>
+Чтобы собрать G4MPI в таком случае нужно добавить параметр ''-DG4MPI_OLD_MPI=ON''
+После этого можно установить G4MPI в указанную ранее папку:
+  make install
 ====== Использование ======
+Список встроенных команд рабочей среды GEANT4 можно просмотреть [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/G4UsersDocuments/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/Control/UIcommands/_.html | здесь]].
 ===== Пример B1 =====
@@ Рядок 49: / Рядок 167: @@
   С использованием графического интерфейса OpenGL:
   cmake -DWITH_GEANT4_UIVIS=ON -DGeant4_DIR=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/lib/Geant4-10.0.2/ ../B1
+  make
   cd /home/user/geant/B1-build/
@@ Рядок 112: / Рядок 231: @@
   Idle> /run/beamOn 10
+===== Параллельные вычисления =====
+==== G4MPI ====
+Согласно [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html | документации G4MPI]], программа на GEANT4, использующая технологии MPI может иметь примерно такую структуру:
+<code c++>
+#include "G4MPImanager.hh"
+#include "G4MPIsession.hh"
+int main(int argc,char** argv)
+{
+  // Создание диспетчера G4MPImanager
+  G4MPImanager* g4MPI= new G4MPImanager(argc,argv);
+  // Создание сессии MPI (G4MPIsession) вместо G4UIterminal
+  G4MPIsession* session= g4MPI-> GetMPIsession();
+  // Далее следует стандартный код программы на GEANT4
+  G4RunManager* runManager= new G4RunManager();
+  ...
+  // После установки всех параметров программы нужно запустить сессию MPI.
+  // MPIsession может работать как в интерактивном, так и в пакетном режиме.
+  session->SessionStart();
+  // В конце выполнения программы
+  delete g4MPI;
+  delete runManager;
+}
+</code>
+Компилировать такую программу нужно следующим образом (предполагается, что все пользовательские программы на GEANT4 находятся в каталоге ''/home/user/geant/'', а текущая программа - в подкаталоге ''MPItest'').
+Сначала нужно указать в ''CMakeLists.txt'' для нашей программы пути к файлам MPI. Для этого нужно отредактировать или добавить такие строки:
+<code txt "CMakeLists.txt">
+# Поиск пакета MPI в системе:
+find_package(MPI REQUIRED)
+# Установка флагов компилятора и компоновщика:
+set(CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS ${CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS} ${MPI_COMPILE_FLAGS})
+set(CMAKE_CXX_LINK_FLAGS ${CMAKE_CXX_LINK_FLAGS} ${MPI_LINK_FLAGS})
+# Путь к заголовочным файлам:
+include_directories(${MPI_INCLUDE_PATH} "/home/user/GEANT4/G4MPI/include/")
+# Путь к библиотекам для компоновки окончательного исполнимого файла программы:
+target_link_libraries(MPItest-program.bin ${MPI_LIBRARIES} ${G4mpi_DIR}/libG4mpi.so)
+</code>
+Затем собственно компиляция:
+<code>
+cd /home/user/geant/
+mkdir MPItest.build
+cd MPItest.build
+. /home/user/GEANT4/bin/geant4.sh
+cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DG4mpi_DIR=/home/user/GEANT4/G4MPI/lib ../MPItest
+make
+</code>
+Запускать полученную программу можно в стандартном окружении MPI. Например,
+  mpirun -n 4 ./MPItest-program.bin
+===== Анимация =====
+При использовании интерфейса Qt правым щелчком мыши по изображению эксперимента вызывается меню, в котором можно выбрать пункт ''Actions'' → ''Movie parameters...''
+{{::movie_parameters.png?200 || }}
+В этом окне можно выбрать параметры записи анимации, а также запустить и остановить её.
+Для того, чтобы этим воспользоваться, необходимо установить пакет [[http://netpbm.alioth.debian.org/ | netpbm]], который будет собирать из отдельных снимков в формате PPM((При этом сами снимки помещаются в подкаталог с именем вида ''QtMovie_12-09-2014_09-27-35'' (имя, по-видимому, соответствует дате и времени запуска) каталога, указанного в окне настроек видео под параметром ''Temporary folder path'')) видеофайл в формате MPEG:
+  sudo apt-get install netpbm
@@ Рядок 118: / Рядок 316: @@
 [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/index.html | Geant4 User's Guide for Application Developers]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06.html | Chapter 6.  User Actions]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06s02.html | Optional User Actions]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s03.html | System of Units]]
+[[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/BackupVersions/V9.6/html/ch11s04.html | FAQ.4.  Tracks and steps]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s04.html#sect.Run.Basic.Manage | Run]]
 [[http://www.geant4.org/geant4/support/training.shtml | GEANT4 Training Courses]]
@@ Рядок 125: / Рядок 333: @@
 http://geant4.slac.stanford.edu/tutorial/mcgill06/HandsOn3/HandsOn3.htm
+[[http://geant4.cern.ch/G4UsersDocuments/UsersGuides/PhysicsReferenceManual/html/PhysicsReferenceManual.html | Physics Reference Manual]]
 http://www.jlab.org/conferences/geant4/
@@ Рядок 136: / Рядок 344: @@
 [[http://content.lib.utah.edu/utils/getfile/collection/etd3/id/2106/filename/2096.pdf | MCNP5 AND GEANT4 COMPARISONS FOR PRELIMINARY FAST NEUTRON PENCIL BEAM DESIGN AT THE UNIVERSITY OF UTAH TRIGA SYSTEM]] by Christian Amevi Adjei
 ===== На русском языке =====