WombatWiki

Користувальницькі налаштування

Налаштування сайту

Відвідано:
hpc

Розбіжності

Тут показані розбіжності між вибраною ревізією та поточною версією сторінки.

Посилання на цей список змін

Наступна ревізія		Попередня ревізія
hpc [2014/04/11 08:19] – створено + debian links wombathpc [2016/09/15 08:58] (поточний) – [OpenMP] ссылка на страницу OpenMP wombat
Рядок 1: Рядок 1:
 +====== Параллельные вычисления ======
 +
 +===== OpenMP =====
 +
 +[[openmp|OpenMP]] -- очень удобный и простой способ распараллелить вычисления, проводимые в рамках одного компьютера (несколько ядер или процессоров, но общая оперативная память).
 +
 +https://computing.llnl.gov/tutorials/openMP/
 +
 +
 +
 +===== MPI =====
 +
 +
 +http://www.mpi-forum.org/docs/docs.html
 +
 +https://computing.llnl.gov/tutorials/mpi/
 +
 +http://mpitutorial.com/beginner-mpi-tutorial/
 +
 +
 +==== OpenMPI ====
 +
 +https://www.open-mpi.org/
 +
 +Сначала нужно настроить [[ssh#подключение_по_ключу|доступ через SSH по ключу]].
 +
 +Для проверки работоспособности системы запустим программу ''hostname'' на нескольких компьютерах из локальной сети:
 +
 +  mpirun -np 2 --host 192.168.1.2,192.168.1.3 hostname
 +
 +После написания [[mpi|программы]] с использованием технологии MPI, запустить её можно так:
 +
 +Компиляция:
 +  mpicc -o mpi-test.bin mpi-test.c
 +
 +Копирование на другие компьютеры:
 +  scp -P22 mpi-test.bin Calculator1:~/
 +
 +Выделение ресурсов [[slurm|SLURM]]:
 +  salloc -n8 /bin/bash
 +
 +Запуск:
 +  mpirun ./mpi-test.bin
 +
 +Опыт показал, что вместо последних двух команд лучше задавать одну такую:
 +  salloc -n8 mpirun ./mpi-test.bin
 +Тогда после завершения работы программы, соответствующее задание удаляется из очереди SLURM, и ресурсы освобождаются для следующих задач.
 +==== MPICH ====
 +
 +http://www.mpich.org/documentation/guides/
 +
 +
 +===== Планировщики задач =====
 +
 +https://research.cs.wisc.edu/htcondor/manual/v8.3/2_9Parallel_Applications.html
 +
 +https://computing.llnl.gov/linux/slurm/
 +
 +http://www.adaptivecomputing.com/products/open-source/torque/
 +
 +== Grun ==
 +
 +> A lightweight replacement for job queueing systems like LSF, Torque, condor, SGE, for private clusters.
 +> ...
 +> Grun doesn't support MPI and other fancy grid things (although you can layer map-reduce on it)
 +
 +https://github.com/earonesty/grun
 +
 +
 +===== Ссылки =====
 +
 +https://wiki.debian.org/DebianBeowulf
 +
 +https://wiki.debian.org/DebianScience/Grid
 +
 +https://wiki.debian.org/DebianScience
 +
 +https://wiki.debian.org/HighPerformanceComputing
 +
 +http://www.debianclusters.net/index.php/Main_Page
 +
 +https://research.cs.wisc.edu/htcondor/manual/v8.3/1_1High_Throughput_Computin.html
 +
 +http://toolkit.globus.org/toolkit/
 +
 +http://www.openlava.org/
 +
 +http://graal.ens-lyon.fr/diet/
 +
 +[[https://computing.llnl.gov/tutorials/linux_clusters/ | LLNL Linux Clusters Overview]]
 +
 +[[https://computing.llnl.gov/tutorials/parallel_comp/ | LLNL Introduction to Parallel Computing]]
 +
 +
 +
 +===== Видеокурсы =====
 +
 +https://class.coursera.org/scicomp-003
 +
 +====== Наблюдение/Управление ======
 +
 +http://ganglia.info
 +
 +
 +