Тут показані розбіжності між вибраною ревізією та поточною версією сторінки.
Both sides previous revision Попередня ревізія Наступна ревізія | Попередня ревізія | ||
geant4 [2014/09/12 09:51] wombat Анимация |
geant4 [2021/11/10 10:47] (поточний) wombat [Файлы данных] Обновление до версии 10.7 |
||
---|---|---|---|
Рядок 6: | Рядок 6: | ||
===== Из исходников ===== | ===== Из исходников ===== | ||
- | Будем следовать рецепту((http://geant4.cern.ch/UserDocumentation/UsersGuides/InstallationGuide/html/ch02.html)) с официального сайта GEANT4. Установим пакеты, которые потребуются для сборки GEANT4: | + | Будем следовать рецепту((https://geant4-userdoc.web.cern.ch/UsersGuides/InstallationGuide/html/installguide.html)) с официального сайта GEANT4. Установим пакеты, которые потребуются для сборки GEANT4: |
apt-get install build-essential cmake libexpat1-dev | apt-get install build-essential cmake libexpat1-dev | ||
Рядок 14: | Рядок 14: | ||
apt-get install libglu1-mesa-dev libxmu-dev | apt-get install libglu1-mesa-dev libxmu-dev | ||
- | Если планируется использовать интерфейс Qt, то: | + | Если планируется использовать интерфейс Qt5, то: |
- | apt-get install libqt4-dev libqt4-opengl-dev | + | apt-get install qtbase5-dev libqt5opengl5-dev |
- | mkdir /home/user/geant/GEANT4-download | + | Если планируется использовать описание геометрии в формате [[https://gdml.web.cern.ch/GDML/|GDML]], то: |
- | cd /home/user/geant/GEANT4-download | + | |
- | wget -cS 'http://geant4.cern.ch/support/source/geant4.10.00.p02.tar.gz' | + | apt-get install libxerces-c-dev |
- | cd ../ | + | |
- | tar -xvf GEANT4-download/geant4.10.00.p02.tar.gz | + | mkdir /home/user/GEANT4-download |
- | mkdir geant4.10.00.p02-build | + | cd /home/user/GEANT4-download |
- | cd geant4.10.00.p02-build/ | + | wget -cS 'https://geant4-data.web.cern.ch/releases/geant4.10.07.p02.tar.gz' |
+ | tar -xvf geant4.10.07.p02.tar.gz | ||
+ | mkdir geant4.10.07.p02-build | ||
+ | cd geant4.10.07.p02-build/ | ||
Без поддержки OpenGL (или интерактивного графического интерфейса вообще? FIXME ) : | Без поддержки OpenGL (или интерактивного графического интерфейса вообще? FIXME ) : | ||
- | cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/geant/geant4.10.00.p02 | + | cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4 -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/GEANT4-download/geant4.10.07.p02 |
Для поддержки OpenGL для X11: ''-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON'' | Для поддержки OpenGL для X11: ''-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON'' | ||
Для поддержки интерфейса Qt: ''-DGEANT4_USE_QT=ON'' | Для поддержки интерфейса Qt: ''-DGEANT4_USE_QT=ON'' | ||
+ | |||
+ | Для поддержки файлов GDML: ''-DGEANT4_USE_GDML=ON'' | ||
==== Файлы данных ==== | ==== Файлы данных ==== | ||
Рядок 39: | Рядок 44: | ||
<code> | <code> | ||
- | *WARNING* | + | *WARNING* |
Geant4 has been pre-configured to look for datasets | Geant4 has been pre-configured to look for datasets | ||
in the directory: | in the directory: | ||
- | /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data | + | /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data |
but the following datasets are NOT present on disk at | but the following datasets are NOT present on disk at | ||
that location: | that location: | ||
- | G4NDL (4.4) | + | G4NDL (4.6) |
- | G4EMLOW (6.35) | + | G4EMLOW (7.13) |
- | PhotonEvaporation (3.0) | + | PhotonEvaporation (5.7) |
- | RadioactiveDecay (4.0) | + | RadioactiveDecay (5.6) |
- | G4NEUTRONXS (1.4) | + | G4PARTICLEXS (3.1.1) |
G4PII (1.3) | G4PII (1.3) | ||
- | RealSurface (1.0) | + | RealSurface (2.2) |
- | G4SAIDDATA (1.1) | + | G4SAIDDATA (2.0) |
- | G4ABLA (3.0) | + | G4ABLA (3.1) |
- | G4ENSDFSTATE (1.0) | + | G4INCL (1.0) |
+ | G4ENSDFSTATE (2.3) | ||
If you want to have these datasets installed automatically | If you want to have these datasets installed automatically | ||
Рядок 76: | Рядок 82: | ||
download the following files: | download the following files: | ||
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4NDL.4.4.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4NDL.4.6.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4EMLOW.6.35.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4EMLOW.7.13.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4PhotonEvaporation.3.0.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PhotonEvaporation.5.7.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4RadioactiveDecay.4.0.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4RadioactiveDecay.5.6.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4NEUTRONXS.1.4.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PARTICLEXS.3.1.1.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4PII.1.3.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4PII.1.3.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/RealSurface.1.0.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4RealSurface.2.2.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4SAIDDATA.1.1.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4SAIDDATA.2.0.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4ABLA.3.0.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4ABLA.3.1.tar.gz |
- | http://geant4.cern.ch/support/source/G4ENSDFSTATE.1.0.tar.gz | + | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4INCL.1.0.tar.gz |
+ | https://cern.ch/geant4-data/datasets/G4ENSDFSTATE.2.3.tar.gz | ||
and unpack them under the directory: | and unpack them under the directory: | ||
- | /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data | + | /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data |
As we supply the datasets packed in gzipped tar files, | As we supply the datasets packed in gzipped tar files, | ||
Рядок 99: | Рядок 106: | ||
</code> | </code> | ||
- | это означает, что файлы данных ещё не установлены. Их можно установить прямо во время сборки, передав cmake параметр ''-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON''. Но это потребует скачивания из интернета (несколькосот МБ). Если эти файлы уже скачаны, их можно вручную распаковать в нужую папку, как и подсказывает нам текстпредупреждения. Для этого: | + | это означает, что файлы данных ещё не установлены. Их можно установить прямо во время сборки, передав cmake параметр ''-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON''. Но это потребует скачивания из интернета (несколькосот МБ). Если эти файлы уже скачаны, их можно вручную распаковать в нужную папку, как и подсказывает нам текст предупреждения. Для этого: |
- | mkdir -p /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data | + | mkdir -p /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data |
- | cd /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data | + | cd /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.7.2/data |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ABLA.3.0.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ABLA.3.1.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4EMLOW.6.35.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4EMLOW.7.13.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ENSDFSTATE.1.0.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ENSDFSTATE.2.3.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4NDL.4.4.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4INCL.1.0.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4NEUTRONXS.1.4.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4NDL.4.6.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PhotonEvaporation.3.0.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PARTICLEXS.3.1.1.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PII.1.3.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PhotonEvaporation.5.7.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4RadioactiveDecay.4.0.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4PII.1.3.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4SAIDDATA.1.1.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4RadioactiveDecay.5.6.tar.gz |
- | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/RealSurface.1.0.tar.gz | + | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4SAIDDATA.2.0.tar.gz |
+ | tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4RealSurface.2.2.tar.gz | ||
После чего можно заново запустить cmake, как это делалось ранее, чтобы убедиться, что он находит все установленные файлы данных. Если это так, можно переходить к компиляции и установке: | После чего можно заново запустить cmake, как это делалось ранее, чтобы убедиться, что он находит все установленные файлы данных. Если это так, можно переходить к компиляции и установке: | ||
Рядок 120: | Рядок 128: | ||
+ | ===== G4MPI ===== | ||
+ | |||
+ | Для использования технологий MPI в GEANT4, нужно скомпилировать и установить библиотеку G4MPI. Она поставляется в архиве последних версий GEANT4 в разделе примеров((http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html)). | ||
+ | |||
+ | mkdir G4MPI.build && cd G4MPI.build | ||
+ | cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4/G4MPI /home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source | ||
+ | make | ||
+ | |||
+ | Если компилятор выдаёт ошибку, приведённую ниже, это означает, что в системе установлена старая версия MPI. | ||
+ | |||
+ | <code> | ||
+ | /home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc: In member function ‘void G4MPIscorerMerger::Pack(const G4VScoringMesh*)’: | ||
+ | /home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc:309:37: error: invalid conversion from ‘const void*’ to ‘void*’ [-fpermissive] | ||
+ | &outputBufferPosition,comm); | ||
+ | ^ | ||
+ | </code> | ||
+ | |||
+ | Чтобы собрать G4MPI в таком случае нужно добавить параметр ''-DG4MPI_OLD_MPI=ON'' | ||
+ | |||
+ | После этого можно установить G4MPI в указанную ранее папку: | ||
+ | |||
+ | make install | ||
====== Использование ====== | ====== Использование ====== | ||
+ | Список встроенных команд рабочей среды GEANT4 можно просмотреть [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/G4UsersDocuments/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/Control/UIcommands/_.html | здесь]]. | ||
===== Пример B1 ===== | ===== Пример B1 ===== | ||
Рядок 136: | Рядок 167: | ||
С использованием графического интерфейса OpenGL: | С использованием графического интерфейса OpenGL: | ||
cmake -DWITH_GEANT4_UIVIS=ON -DGeant4_DIR=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/lib/Geant4-10.0.2/ ../B1 | cmake -DWITH_GEANT4_UIVIS=ON -DGeant4_DIR=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/lib/Geant4-10.0.2/ ../B1 | ||
+ | make | ||
cd /home/user/geant/B1-build/ | cd /home/user/geant/B1-build/ | ||
Рядок 199: | Рядок 231: | ||
Idle> /run/beamOn 10 | Idle> /run/beamOn 10 | ||
+ | |||
+ | ===== Параллельные вычисления ===== | ||
+ | |||
+ | ==== G4MPI ==== | ||
+ | |||
+ | Согласно [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html | документации G4MPI]], программа на GEANT4, использующая технологии MPI может иметь примерно такую структуру: | ||
+ | |||
+ | <code c++> | ||
+ | #include "G4MPImanager.hh" | ||
+ | #include "G4MPIsession.hh" | ||
+ | |||
+ | int main(int argc,char** argv) | ||
+ | { | ||
+ | // Создание диспетчера G4MPImanager | ||
+ | G4MPImanager* g4MPI= new G4MPImanager(argc,argv); | ||
+ | | ||
+ | // Создание сессии MPI (G4MPIsession) вместо G4UIterminal | ||
+ | G4MPIsession* session= g4MPI-> GetMPIsession(); | ||
+ | | ||
+ | // Далее следует стандартный код программы на GEANT4 | ||
+ | G4RunManager* runManager= new G4RunManager(); | ||
+ | |||
+ | ... | ||
+ | |||
+ | // После установки всех параметров программы нужно запустить сессию MPI. | ||
+ | // MPIsession может работать как в интерактивном, так и в пакетном режиме. | ||
+ | session->SessionStart(); | ||
+ | |||
+ | // В конце выполнения программы | ||
+ | delete g4MPI; | ||
+ | delete runManager; | ||
+ | } | ||
+ | </code> | ||
+ | |||
+ | Компилировать такую программу нужно следующим образом (предполагается, что все пользовательские программы на GEANT4 находятся в каталоге ''/home/user/geant/'', а текущая программа - в подкаталоге ''MPItest''). | ||
+ | |||
+ | Сначала нужно указать в ''CMakeLists.txt'' для нашей программы пути к файлам MPI. Для этого нужно отредактировать или добавить такие строки: | ||
+ | |||
+ | <code txt "CMakeLists.txt"> | ||
+ | # Поиск пакета MPI в системе: | ||
+ | find_package(MPI REQUIRED) | ||
+ | |||
+ | # Установка флагов компилятора и компоновщика: | ||
+ | set(CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS ${CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS} ${MPI_COMPILE_FLAGS}) | ||
+ | set(CMAKE_CXX_LINK_FLAGS ${CMAKE_CXX_LINK_FLAGS} ${MPI_LINK_FLAGS}) | ||
+ | |||
+ | # Путь к заголовочным файлам: | ||
+ | include_directories(${MPI_INCLUDE_PATH} "/home/user/GEANT4/G4MPI/include/") | ||
+ | |||
+ | # Путь к библиотекам для компоновки окончательного исполнимого файла программы: | ||
+ | target_link_libraries(MPItest-program.bin ${MPI_LIBRARIES} ${G4mpi_DIR}/libG4mpi.so) | ||
+ | </code> | ||
+ | |||
+ | Затем собственно компиляция: | ||
+ | |||
+ | <code> | ||
+ | cd /home/user/geant/ | ||
+ | mkdir MPItest.build | ||
+ | cd MPItest.build | ||
+ | . /home/user/GEANT4/bin/geant4.sh | ||
+ | cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DG4mpi_DIR=/home/user/GEANT4/G4MPI/lib ../MPItest | ||
+ | make | ||
+ | </code> | ||
+ | |||
+ | Запускать полученную программу можно в стандартном окружении MPI. Например, | ||
+ | |||
+ | mpirun -n 4 ./MPItest-program.bin | ||
Рядок 207: | Рядок 306: | ||
{{::movie_parameters.png?200 || }} | {{::movie_parameters.png?200 || }} | ||
В этом окне можно выбрать параметры записи анимации, а также запустить и остановить её. | В этом окне можно выбрать параметры записи анимации, а также запустить и остановить её. | ||
+ | |||
+ | Для того, чтобы этим воспользоваться, необходимо установить пакет [[http://netpbm.alioth.debian.org/ | netpbm]], который будет собирать из отдельных снимков в формате PPM((При этом сами снимки помещаются в подкаталог с именем вида ''QtMovie_12-09-2014_09-27-35'' (имя, по-видимому, соответствует дате и времени запуска) каталога, указанного в окне настроек видео под параметром ''Temporary folder path'')) видеофайл в формате MPEG: | ||
+ | |||
+ | sudo apt-get install netpbm | ||
Рядок 213: | Рядок 316: | ||
[[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/index.html | Geant4 User's Guide for Application Developers]] | [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/index.html | Geant4 User's Guide for Application Developers]] | ||
+ | |||
+ | [[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06.html | Chapter 6. User Actions]] | ||
+ | |||
+ | [[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06s02.html | Optional User Actions]] | ||
+ | |||
+ | [[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s03.html | System of Units]] | ||
+ | |||
+ | [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/BackupVersions/V9.6/html/ch11s04.html | FAQ.4. Tracks and steps]] | ||
+ | |||
+ | [[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s04.html#sect.Run.Basic.Manage | Run]] | ||
[[http://www.geant4.org/geant4/support/training.shtml | GEANT4 Training Courses]] | [[http://www.geant4.org/geant4/support/training.shtml | GEANT4 Training Courses]] | ||
Рядок 220: | Рядок 333: | ||
http://geant4.slac.stanford.edu/tutorial/mcgill06/HandsOn3/HandsOn3.htm | http://geant4.slac.stanford.edu/tutorial/mcgill06/HandsOn3/HandsOn3.htm | ||
+ | [[http://geant4.cern.ch/G4UsersDocuments/UsersGuides/PhysicsReferenceManual/html/PhysicsReferenceManual.html | Physics Reference Manual]] | ||
http://www.jlab.org/conferences/geant4/ | http://www.jlab.org/conferences/geant4/ | ||
Рядок 231: | Рядок 344: | ||
[[http://content.lib.utah.edu/utils/getfile/collection/etd3/id/2106/filename/2096.pdf | MCNP5 AND GEANT4 COMPARISONS FOR PRELIMINARY FAST NEUTRON PENCIL BEAM DESIGN AT THE UNIVERSITY OF UTAH TRIGA SYSTEM]] by Christian Amevi Adjei | [[http://content.lib.utah.edu/utils/getfile/collection/etd3/id/2106/filename/2096.pdf | MCNP5 AND GEANT4 COMPARISONS FOR PRELIMINARY FAST NEUTRON PENCIL BEAM DESIGN AT THE UNIVERSITY OF UTAH TRIGA SYSTEM]] by Christian Amevi Adjei | ||
- | |||
===== На русском языке ===== | ===== На русском языке ===== | ||