Розбіжності

Тут показані розбіжності між вибраною ревізією та поточною версією сторінки.

--- geant4 [2014/11/09 14:19]
wombat [Использование] Список встроенных команд
+++ geant4 [2016/04/03 10:57]
wombat [G4MPI] CMakeLists.txt
@@ Рядок 18: / Рядок 18: @@
   apt-get install libqt4-dev libqt4-opengl-dev
-  mkdir /home/user/geant/GEANT4-download
+  mkdir /home/user/GEANT4-download
-  cd /home/user/geant/GEANT4-download
+  cd /home/user/GEANT4-download
   wget -cS 'http://geant4.cern.ch/support/source/geant4.10.00.p02.tar.gz'
-  cd ../
+  tar -xvf geant4.10.00.p02.tar.gz
-  tar -xvf GEANT4-download/geant4.10.00.p02.tar.gz
   mkdir geant4.10.00.p02-build
   cd geant4.10.00.p02-build/
@@ Рядок 28: / Рядок 27: @@
 Без поддержки OpenGL (или интерактивного графического интерфейса вообще? FIXME ) :
-  cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/geant/geant4.10.00.p02-install -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/geant/geant4.10.00.p02
+  cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4 -DGEANT4_BUILD_MULTITHREADED=ON /home/user/GEANT4-download/geant4.10.00.p02
 Для поддержки OpenGL для X11: ''-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON''
@@ Рядок 43: / Рядок 42: @@
     in the directory:
-    /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data
+    /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.0.2/data
     but the following datasets are NOT present on disk at
@@ Рядок 89: / Рядок 88: @@
     and unpack them under the directory:
-    /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data
+    /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.0.2/data
     As we supply the datasets packed in gzipped tar files,
@@ Рядок 99: / Рядок 98: @@
 </code>
-это означает, что файлы данных ещё не установлены. Их можно установить прямо во время сборки, передав cmake параметр ''-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON''. Но это потребует скачивания из интернета (несколькосот МБ). Если эти файлы уже скачаны, их можно вручную распаковать в нужую папку, как и подсказывает нам текстпредупреждения. Для этого:
+это означает, что файлы данных ещё не установлены. Их можно установить прямо во время сборки, передав cmake параметр ''-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON''. Но это потребует скачивания из интернета (несколькосот МБ). Если эти файлы уже скачаны, их можно вручную распаковать в нужую папку, как и подсказывает нам текст предупреждения(([[ftp://gdo-nuclear.ucllnl.org/pub/|Дополнительные файлы данных]])). Для этого:
-  mkdir -p /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data
+  mkdir -p /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.0.2/data
-  cd /home/user/geant/geant4.10.00.p02-install/share/Geant4-10.0.2/data
+  cd /home/user/GEANT4/share/Geant4-10.0.2/data
   tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4ABLA.3.0.tar.gz
   tar -xvf /home/user/GEANT4-download/G4EMLOW.6.35.tar.gz
@@ Рядок 120: / Рядок 119: @@
+===== G4MPI =====
+Для использования технологий MPI в GEANT4, нужно скомпилировать и установить библиотеку G4MPI. Она поставляется в архиве последних версий GEANT4 в разделе примеров((http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html)).
+  mkdir G4MPI.build && cd G4MPI.build
+  cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/user/GEANT4/G4MPI /home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source
+  make
+Если компилятор выдаёт ошибку, приведённую ниже, это означает, что в системе установлена старая версия MPI.
+<code>
+/home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc: In member function ‘void G4MPIscorerMerger::Pack(const G4VScoringMesh*)’:
+/home/user/GEANT4-download/geant4.10.02.p01/examples/extended/parallel/MPI/source/src/G4MPIscorerMerger.cc:309:37: error: invalid conversion from ‘const void*’ to ‘void*’ [-fpermissive]
+           &outputBufferPosition,comm);
+                                     ^
+</code>
+Чтобы собрать G4MPI в таком случае нужно добавить параметр ''-DG4MPI_OLD_MPI=ON''
+После этого можно установить G4MPI в указанную ранее папку:
+  make install
@@ Рядок 201: / Рядок 222: @@
   Idle> /run/beamOn 10
+===== Параллельные вычисления =====
+==== G4MPI ====
+Согласно [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/Doxygen/examples_doc/html/Examples_MPI.html | документации G4MPI]], программа на GEANT4, использующая технологии MPI может иметь примерно такую структуру:
+<code c++>
+#include "G4MPImanager.hh"
+#include "G4MPIsession.hh"
+int main(int argc,char** argv)
+{
+  // Создание диспетчера G4MPImanager
+  G4MPImanager* g4MPI= new G4MPImanager(argc,argv);
+  // Создание сессии MPI (G4MPIsession) вместо G4UIterminal
+  G4MPIsession* session= g4MPI-> GetMPIsession();
+  // Далее следует стандартный код программы на GEANT4
+  G4RunManager* runManager= new G4RunManager();
+  ...
+  // После установки всех параметров программы нужно запустить сессию MPI.
+  // MPIsession может работать как в интерактивном, так и в пакетном режиме.
+  session->SessionStart();
+  // В конце выполнения программы
+  delete g4MPI;
+  delete runManager;
+}
+</code>
+Компилировать такую программу нужно следующим образом (предполагается, что все пользовательские программы на GEANT4 находятся в каталоге ''/home/user/geant/'', а текущая программа - в подкаталоге ''MPItest'').
+Сначала нужно указать в ''CMakeLists.txt'' для нашей программы пути к файлам MPI. Для этого нужно отредактировать или добавить такие строки:
+<code txt "CMakeLists.txt">
+# Поиск пакета MPI в системе:
+find_package(MPI REQUIRED)
+# Установка флагов компилятора и компоновщика:
+set(CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS ${CMAKE_CXX_COMPILE_FLAGS} ${MPI_COMPILE_FLAGS})
+set(CMAKE_CXX_LINK_FLAGS ${CMAKE_CXX_LINK_FLAGS} ${MPI_LINK_FLAGS})
+# Путь к заголовочным файлам:
+include_directories(${MPI_INCLUDE_PATH} "/home/user/GEANT4/G4MPI/include/")
+# Путь к библиотекам для компоновки окончательного исполнимого файла программы:
+target_link_libraries(MPItest-program.bin ${MPI_LIBRARIES} ${G4mpi_DIR}/libG4mpi.so)
+</code>
+Затем собственно компиляция:
+<code>
+cd /home/user/geant/
+mkdir MPItest.build
+cd MPItest.build
+. /home/user/GEANT4/bin/geant4.sh
+cmake -DGeant4_DIR=/home/user/GEANT4/lib/Geant4-10.2.1 -DG4mpi_DIR=/home/user/GEANT4/G4MPI/lib ../MPItest
+make
+</code>
+Запускать полученную программу можно в стандартном окружении MPI. Например,
+  mpirun -n 4 ./MPItest-program.bin
@@ Рядок 219: / Рядок 307: @@
 [[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/index.html | Geant4 User's Guide for Application Developers]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06.html | Chapter 6.  User Actions]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch06s02.html | Optional User Actions]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s03.html | System of Units]]
+[[http://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/BackupVersions/V9.6/html/ch11s04.html | FAQ.4.  Tracks and steps]]
+[[https://geant4.web.cern.ch/geant4/UserDocumentation/UsersGuides/ForApplicationDeveloper/html/ch03s04.html#sect.Run.Basic.Manage | Run]]
 [[http://www.geant4.org/geant4/support/training.shtml | GEANT4 Training Courses]]
@@ Рядок 226: / Рядок 324: @@
 http://geant4.slac.stanford.edu/tutorial/mcgill06/HandsOn3/HandsOn3.htm
+[[http://geant4.cern.ch/G4UsersDocuments/UsersGuides/PhysicsReferenceManual/html/PhysicsReferenceManual.html | Physics Reference Manual]]
 http://www.jlab.org/conferences/geant4/
@@ Рядок 237: / Рядок 335: @@
 [[http://content.lib.utah.edu/utils/getfile/collection/etd3/id/2106/filename/2096.pdf | MCNP5 AND GEANT4 COMPARISONS FOR PRELIMINARY FAST NEUTRON PENCIL BEAM DESIGN AT THE UNIVERSITY OF UTAH TRIGA SYSTEM]] by Christian Amevi Adjei
 ===== На русском языке =====

WombatWiki

Користувальницькькі налаштування

Налаштування сайту

Розбіжності

Налаштування сторінки